Keanggotaan PPKBMI terbuka secara umum bagi indvidu yang memanuhi persyaratan sebagai berikut:
- Pengelola koleksi biakan mikroorganisme di Indonesia yang terdaftar di World Federation for Culture Collections.
- Peneliti atau non-peneliti yang memiliki dan memelihara koleksi biakan mikroorganisme .
- Peneliti atau non-peneliti yang memiliki minat tentang koleksi biakan mikroorganisme.
Pendaftaran anggota dapat dilakukan dengan mengisi form pendaftaran di link ini https://s.id/PendaftaranPPKBMI. Iuran keanggotaan sebesar Rp. 200.000,- dibayarkan setiap tahun.